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GoogleCloud为健康研究人员存储数PB的基因组数据

2019-09-02     来源:秦风网         内容标签:GoogleCloud,为,健康,研究人员,存储,数,的,G

导读:Google继续扩大其在医疗领域的努力。他们宣布了一种新的GenomeCloud,用于存储数千个人类基因组文件。谷歌每年每个基因组收费25美元,这对云存储来说相当昂贵。但考虑到每个基因组文

Google继续扩大其在医疗领域的努力。他们宣布了一种新的GenomeCloud,用于存储数千个人类基因组文件。

谷歌每年每个基因组收费25美元,这对云存储来说相当昂贵。但考虑到每个基因组文件包含大约100GB的数据,这对潜在客户来说似乎更合理。

对于研究人员或医生来说,令人兴奋的部分是不仅可以获得相当大的患者基因组数据库,谷歌的搜索工具将允许非常快速地处理数据,这有望导致意义例如,对癌症遗传基础的深入了解。

但基因组比较技术也可用于研究其他与遗传相关的健康状况。

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Google已经从科学界做出了一些重要承诺。国家癌症研究所正在将2.6PB的数据复制到云端,耗资1900万美元。谷歌与亚马逊(Amazon.com)竞争这种基因组数据存储业务。美国国家癌症研究所打算在亚马逊网络服务云上存储他们数据库的第二份副本。

遗传学家,多伦多儿童医院应用基因组学中心主任StephenScherer博士与AutismSpeaks和Google合作,以5000万美元的努力确定了自闭症的可能遗传根源,这使得68名出生在美国的婴儿受到影响。他们已经有了有用的发现,其中Scherer博士能够证明这一点。自闭症实际上是不止一种病症的保护伞。

“我们有新的未发表的数据显示自闭症实际上是不同疾病的集合,”Scherer博士在接受CNBC采访时表示,“这是很多情况下,即使在兄弟姐妹患有自闭症的家庭中,他们也常常有不同形式的病症,因此需要以特定于其子类型的方式进行治疗。“

BobWright,co-AutismSpeaks的创始人告诉CNBC,“我认为这将打开整个autis世界研究。希望我们能够在18到24个月的时间内完成25年的研究。“

一些软件供应商正在创建工具来帮助研究人员完成任务。这些工具包括SevenBridges,TuteGenomics和NextCode健康。

“就药物的影响而言;广泛的存储问题是次要的:您可以将原始数据存储在您的服务器上,我们的或谷歌或亚马逊上的云上。重要的是-这就是现在的挑战-是能够有效地理解数据,并将其存储在数据库模型中,使您能够有效地使用它,“NextCode通信副总裁EdFarmer表示,告诉eWEEK。

“你需要能够针对已知与疾病有关的遗传变异组件运行样本,基本上是即时的,因为这是最简单的一点,”Farmer说。“绝大多数那些不会产生致病突变的病例。所以你需要能够根据一系列遗传模式进行搜索,能够利用所有主要的公共参考数据集,并拥有有效检测从头变异的算法Farmer解释说,它占了很大比例的罕见遗传病。

对于常见疾病(老年痴呆症,心脏病等),您需要能够查询来自数十年的全基因组数据成千上万的病人和控制人员,一些调度,“他说。“在这里,我们的系统一直支持冰岛开展的最大规模的研究-我们的技术已经开发出来。”

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